斯坦福HGDP SNP基因分型数据
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背景描述
基因型在Illumina 650Y阵列上生成,GenCall评分截止值为0.25。
总体呼叫率<98.5%的样本被删除。
没有对SNP进行过滤,因此请注意这些文件中包含低质量的SNP。
数据说明
HGDP_FinalReport_Forward.txt
用于1043个样本(列)和660918个标记(行)的制表符分隔(矩阵格式)基因型。给出正向链,没有指定“ - ”。
HGDP_Map.txt
制表符分隔的660918个标记列表,包括染色体和Build 36.1坐标。
HGDP_SampleList.txt
包含的样本列表。