斯坦福HGDP SNP基因分型数据

斯坦福HGDP SNP基因分型数据

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背景描述

  基因型在Illumina 650Y阵列上生成,GenCall评分截止值为0.25。
  总体呼叫率<98.5%的样本被删除。
  没有对SNP进行过滤,因此请注意这些文件中包含低质量的SNP。

 

数据说明

  HGDP_FinalReport_Forward.txt
  用于1043个样本(列)和660918个标记(行)的制表符分隔(矩阵格式)基因型。给出正向链,没有指定“ - ”。

  HGDP_Map.txt
  制表符分隔的660918个标记列表,包括染色体和Build 36.1坐标。

  HGDP_SampleList.txt
  包含的样本列表。